Ditjen Farmalkes melakukan pelayanan dalam bidang kefarmasian dan alat kesehatan meliputi:

1. Perizinan Industri Farmasi, Industri Obat Tradisional (IOT) dan Industri Ekstrak Bahan Alam (IEBA)
2. Perizinan Pedagang Besar Farmasi
3. Izin Edar serta Izin Penyalur Alat Kesehatan (Alkes) dan Perbekalan Kesehatan Rumah Tangga (PKRT)
4. Perizinan Impor Narkotika, Psikotropika dan Prekursor Farmasi
5. Perizinan Kosmetika
6. Pelayanan Surat Keterangan untuk Alat Kesehatan dan PKRT meliputi:
   – Sertifikat Bebas Jual ( Certificate of Free Sale/CFS)
   – Sertifikat Pemberitahuan Ekspor (Certificate of Exportation)
   – Sertifikat Kesehatan (Health Certificate)
   – Surat keterangan Impor (SKI ) khusus (Special Access scheme/ SAS)
   – Surat keterangan Impor (SKI) untuk sampel dalam rangka izin edar
   – Surat keterangan Impor (SKI) untuk bahan baku
   – Surat keterangan Impor (SKI) untuk spare part
   – Surat Keterangan Produk (SKP)  untuk pengadaan sektor pemerintah
   – Surat Keterangan Produk (SKP) untuk perusahaan/perorangan
   – Surat Keterangan Impor (Bea dan Cukai)
   – Surat Keterangan sedang dalam proses perpanjangan/perubahan izin edar
   – Surat Keterangan sedang dalam proses perpanjangan/perubahan IPAK dan Sertifikat Produksi Alkes/PKRT
   – Surat Rekomendasi/ Keterangan Lain