Farmakope Herbal Indonesia berisikan ketentuan umum serta 70 monografi simplisia dan ekstrak. Di samping itu terdapat lampiran-lampiran yang berisikan informasi dan penjelasan metode analisis dan prosedur pengujian yang terdapat di dalam monografi, yang mencakup pengujian dan penetapan secara umum, mikrobiologi, biologi, kimia dan fisika. Sedangkan farmakologi belum dapat dimasukan ke dalam farmakope edisi pertama ini karena belum banyak sumber data yang memenuhi syarat. Akan tetapi untuk monografi baik simplisia atau ekstrak yang sudah mempunyai evidence based atau dasar pembuktian yang dapat digunakan sebagai bahan berkhasiat untuk suatu indikasi terhadap penyakit tertentu akan dimuat sebagai suplemen dari buku ini.