Pedoman pemakaian obat di bidang Penyakit Dalam dengan 12 Sub Spesialisnya mutlak diperlukan karena jenis obat yang beredar sangat beragam. Tim Penyusun Formularium PB PAPDI dalam menyusun obat yang akan digunakan mengacu kepada : Tatalaksana berbagai penyakit yang ada di Buku Ajar Ilmu Penyakit Dalam , Buku Panduan Pelayanan Medis Penyakit Dalam dan konsensus yang sudah ada atau yang diadop oleh Perhimpunan Subspesialis yang tentunya disusun berdasarkan azas efi kasi, keamanan, kualitas, ketersediaan dan harga yang ekonomis.